突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
这是导演佐藤达夫的突破之作，他后来凭借《火星继承者：抚子》一举成名。这部动画讲述了三个少男少女组成的“少年侦探社”侦破神秘案件的故事，充满了戏仿的元素。五年级的小学生花冈勇和她的同学月影俊、雪见聪在一间仓库的地下室里发现了她们祖先——新选组的记录。三名少女意识到她们的使命是对抗邪恶的黑天狗一族，于是她们带着“新选组”（一群正义的盟友）给予她们的三件物品，出发去惩罚黑天狗一族以及在小镇上肆虐的各种恶棍。
张玄和林清菡经历种种，互诉衷肠，终成正果。幸福而平静的生活向两人招手，殊不知暗藏的危险也终于露出了爪牙：神秘组织绑架了林清菡！ 林氏集团的软饭男，为了守护自己唯一的爱人，为了保护和她的平凡生活，终重拾昔日身份。那个曾让地下世界颤抖的男人——“地狱君王”，重出了江湖！ 无人知晓的地下势力纷纷浮出水面！有诡秘莫测的炎夏氏族，重出江湖！也有活在传说中的古武者向脆弱的世界，伸出了他们的饕鬄之手！更有流传千年的神秘组织，出现在世人眼前！他们所求之事虽各不相同，但同有一个共同的敌人：张玄！ 踏上征程的张玄对此一无所知…
