近未来的东京，有着一个为了夺取“最强武器”而建立的两大组织，以开发最强兵器为目的的导示重工，和通过操控遗传因子来制造优秀人类的NSWF。他们的共同目的只有一个，就是得到那个拥有着最强威力、并且只有通过被选中的女人才能操纵的终极武器“WITCHBLADE”。地震灾害的6年之后……天羽雅音、梨穂子 ，两人幸福的生活着，但是，等待着她们的却是，WITCHBLADE那暗之力的召唤，以及异常残酷的命运……
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这是一个灵气为王的世界，谁拥有吞天噬月的灵力，谁就是大主宰！ 大千世界，万道争锋。主宰之路，谁主沉浮？ 少年牧尘，资质卓绝，出生于北灵境九大域之一牧域。父亲是牧域之主牧锋，如今已是北灵盟盟主，母亲清衍静是浮屠古族的神女，在其年幼时为保护儿子和丈夫而被迫离开。从此牧尘立下誓言，将来一定要找回母亲。 在经历腥风血雨后，解救母亲，成为浮屠古族的族长。在万古会中，牧尘成功获得万古不朽身，跻身大千世界颠峰层次的存在之一，为了拯救大千世界的生灵，牧尘闭关五年后，突破出关超脱圣品，与炎帝“萧炎”、武祖“林动”合力对战天邪神。他们消灭了为祸人间的邪族，并以世界之力净化被域外邪族夺走的另一半的大千世界。最终，牧尘成功在苍穹榜上留下完整真名，并将其命名为"主宰境"，与萧炎、林动一起成为大千世界的守护者。
