新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来，人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员，与研究所员齐心协力，面对强大的敌人！究竟“漆黑新干线”的目的是……。孩子们能否守护日本的未来……。变身！SHINKALION！
花园由美是一个 9 岁的女孩，她最大的乐趣就是画画。有一天，为了感谢她珍惜花朵，花仙子柿丸和毛毛丸送给她一根魔杖。无论你用拐杖画什么，它都会呈现出来，就像真实的东西一样。悠米兴奋地挥舞着手杖，但是手杖的效果是有时间限制的。然而，自从得到这根神奇的棍子后，她的日常生活就充满了刺激和冒险。
