年幼的爱力克兄弟十分思念去世的母亲,不惜触犯炼金术中最大的禁忌,进行了人体炼成。可是炼成失败了,哥哥爱德华失去了左腿与右臂,弟弟阿尔冯斯失去了肉体,只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了偿还他们自己的罪,找回失去的一切,兄弟二人踏上了寻找传说中的“贤者之石”的旅程。几年后,一位右臂与左腿都是由“机械铠甲”替代的国家炼金术士出现在人们的眼前,他被称作“钢之炼金术师”。
在文明遍布星河的银河系,星际拾荒者凯恩与养父老杰克,搭乘“破晓号”飞船漂泊宇宙,靠打捞太空垃圾维生。一次意外,他获得了蕴含改变银河系命运的远古星核碎片。邪恶组织“虚空收割者”正搜寻碎片,妄图启动“归零协议”,释放暗黑势力覆灭银河。凯恩邂逅前星际联盟特工薇拉,二人并肩作战,对抗黑暗势力,粉碎阴谋,守护人类与银河系的存续。