蛇妖许黑诞生灵智后，因偷食陈家镇的猪闯入猪圈，恰巧遇上被混混扔进来、后被仙人夺舍重生的陈凡。许黑误将陈凡当作可怕的捕蛇人，情急之下吞了他，却没想到陈凡在其腹中不仅没死，还试图夺取他的妖核。一番争斗后，许黑妖核破裂、身受重伤。危急时刻，陈凡的妖族至宝妖神鼎意外吸收了许黑的妖核碎片，反将陈凡吞噬。最终，许黑在光效作用下身体逐渐修复，倒影化作蛟龙。
主人公赵小天天赋异能，拥有超强的自愈能力。在历经一场意外场爆炸后，他来到了一个崇尚武道的新世界，并成为了首富赵家的嫡孙。但这一身份却让他屡遭歹人迫害
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
