故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了，小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了!在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
主人公小俊意外认识了来自马奇纳星球的警车机器人——炫蓝闪电，并得知地球上现在潜伏着很多来自马奇纳星球的炫卡斗士。为了地球的和平，勇敢的小俊和炫蓝闪电一起踏上了封装炫卡斗士的冒险旅途，寻求人类和炫卡斗士和谐共存的方式。小俊因此结识了各式各样的炫卡斗士，开展惊险刺激的冒险故事……
架空战国时代的日本被未知生命体“鬼神”统治已有150年，唯有“武士团”反抗其统治，一直不懈抗争。武藏和小次郎也曾向往着武士，发誓有朝一日结成最强的武士团。可是，他们所生活的城镇却将鬼神奉为神明，将武士视为异端。武藏只能将梦想藏在心中，直到有一天，他遭遇了人类被鬼残忍杀害的一幕。为了重拾与小次郎的誓言，武藏向强大的鬼发起了挑战…！
