斗罗大陆3龙王传说故事结束一万年后，冰化了，斗罗联邦科考队在极北之地科考时发现了一个有着金银双色花纹的蛋，用仪器探察之后，发现里面居然有生命体征，赶忙将其带回研究所进行孵化。蛋孵化出来了，可孵出来的却是一个婴儿，和人类一模一样的婴儿，一个蛋生的孩子。
《灵境幻世》是拥有超高人气的虚拟现实游戏，其开发者卢危达来自未来。卢危达在未来世界因为诈骗罪而被通缉，他潜逃到现世，用他掌握的未来科技，先于历史开发出灵境空间技术，从而赚取巨额财富。卢危达的真正目的是让游戏中的怪物基美拉出现在现实世界中，最终统治世界。为了抓捕卢危达，来自未来世界的超时空护卫队派出了灵境巡逻员陆彩风。陆彩风发现大学生龙小峰是合适的人选。龙小峰经过刻苦特训，成长为了一名优秀的战士。与此同时，基美拉开始出现在现实世界，龙小峰的妹妹龙玲玲也受到了卢危达的控制。为了找回妹妹、保卫家园，龙小峰开始了讨伐游戏中穿越而来的各种怪物的艰巨挑战。
