1989年，日本。乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
宇宙护卫队为应对霹雳率领的超甲恐龙队，全面升级装备：机车可变形为专属机甲，小雨点则能结合动物召唤出特性武器。双方展开科技与智慧的较量，护卫队在战斗中协作无间，不仅帮助动物解决问题，更向它们学习本领，实现共同成长。一次次挫败敌人阴谋的同时，也守护了地球的和平与希望。
暴雪天微服出访的楚渊，偶然发现流放官员陆长风所建黑石堡，堡内地暖、温室、平价医馆等工业设施让他惊叹。二人查出首辅联合总兵垄断煤炭、制造京城煤荒的阴谋，总兵随即率军围城灭口，楚渊与掌握工业基建、心怀百姓的陆长风联手，共抗奸佞大军。
