继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
林飞身为上古神尊，拥有无尽寿元，长生万万年，曾点化过数不尽的门徒。时过境迁，不灭之神降临都市，才发现就连昔日最不争气的弟子后代，如今也成为了赫赫有名的人物，而围绕林飞的隐藏阴谋也在暗中展开。不灭之神必证最强之道！杀敌要诛心，打脸要彻底——“我，只不过是个大罗金仙！”。
