1996年,人类的探索之旅延伸至地球之外的火星,但美苏冷战的战火也蔓延到了火星。同年10月3日,一群被选入联合国赞助的宇宙文化社(太空体验班)的青少年抵达火星,却突然遭到名为SPT的神秘移动武器的袭击。驾驶着蓝色SPT的少年阿尔巴特罗斯·纳尔·阿格·阿苏卡挺身而出,将他们从困境中解救出来。他透露,地球正遭受格拉多斯星球的威胁,而他自己则是半地球人半格拉多斯人的混血儿。宇宙文化社的青少年们起初对阿格抱有怀疑,但在战斗中,他们的友谊逐渐加深。为了共同返回地球,他们逃离了火星,踏上了艰辛的旅程。
奥斯特拉尔岛,位于萨摩亚群岛东南2000公里处。为了揭开这座已被地图抹去名字的岛屿的秘密,田上悠追随已故父亲的足迹,踏上了一段冒险之旅。在父亲的朋友威尔博士、妹妹多丽丝以及威尔自称“船长”的朋友的帮助下,悠前往岛屿,却遭到巨型企业“盖尔”和由猞猁夫人领导的“美洲狮帮”的追捕。就在悠和他的伙伴们终于抵达岛屿时,他们突然遭到一只神秘怪物的袭击。正当他们看似绝望之际,一个巨大的蓝色机器人出现,摧毁了怪物,救下了悠。尽管这是悠第一次遇到超越人类理解的存在,但他却感到一种莫名的温暖和熟悉感。
帕丁顿熊的到来不是为了历险。它似乎是为了寻找“他”,而当它找到时,又似乎什么都没有发生。有一点可以确定的是——无论帕丁顿熊来到哪里,就会给那里带来一片混乱,一点点恐慌和很多很多的笑声。