贝丽尔·加德南特（Beryl Gardenant）是一位谦逊的中年剑术教练，在乡村经营着一家道场。努力达到剑术巅峰的日子早已一去不复返，他已经接受了自己的能力并过着无忧无虑的生活，十年后的一天，他的一位前学生阿留西亚 (Aleucia) 来看望他，她现在已经升任为王国骑士团的指挥官。 “我已经推荐你担任骑士团的特邀教官，并且已经获得批准。”贝莉尔已经决定在乡下安静地度过余生，并且对此感到满意，但她的命运即将发生巨大的改变！住在城市里。与已经成长了很多的以前的同学重聚。结识新的盟友和强大的敌人。 “对于我这样一个过了巅峰期的老人来说，这太过分了……”贝利尔心里想着，但他长期刻苦磨练的剑术，
他已经达到了令人难以置信的水平，被称为“乡下剑圣”——
魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
