《神探狄仁杰3》分为《凉州案-黑衣社》和《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中饰）允准回老家并州修养。然而就像护卫李元芳（张子健饰）所言，这看似颐养天年的平静中却蕴藏着更大的杀机与阴谋。
传说中，不夜玉可治百病，但却带致命诅咒，唯阮家女心头血可解。顾绥之为了破除活不过三十岁的宿命，设局让阮家孤女阮姝爱上他，两人在爱与救赎间挣扎时，却意外唤醒前世恩怨……
拥有超凡五感的美食记者夏之禾在遇致味轩餐厅老板陆天作后，突然失去五感，丢了工作，陷入人生困境。为揭示真相，她混入餐厅，却在与陆天作相处中引发了敌人陆琪的连番陷害，餐厅岌岌可危。为救陆天作的餐厅，两人契约联姻，在他们因戏生爱之际，夏之禾发现陆天作另有女友，陆天作发现妻子才是抢夺餐厅的幕后黑手，两人陷入爱恨纠葛，未来该何去何从？
