虽然说青春期的男孩子对女孩子感兴趣是极为正常和健康的事情，但少年横寺阳人（梶裕贵 配音）显然已经超出了正常的范围，在他的脑子里，除了妹子外别无他物，就连加入田径社这么热血的事情，也只是因为可以看见游泳社的女孩子们穿泳装。田径社社长似乎想把自己的位子传给阳人，而阳人温吞的性格导致他根本无法拒绝。
身怀灵气转化天赋的沈甜，同伙伴深入幻雾沼泽寻灵物，遭遇可幻化人形的守护生灵，对方复刻她的容貌制造迷局。众人依靠专属回忆戳破幻境，辗转多地集齐五样灵物，一路受万千异兽帮扶。殊不知暗处敌人早已布下连环圈套，无数真假难辨的幻象与凶险考验，正等候他们踏入。
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
