小学时期，游泳部的四名成员在毕业前的游泳比赛中夺冠，之后他们毕业的毕业，出国的出国，四人分道扬镳。时过境迁，就读岩鸢高中的七濑遥（岛崎信长 配音）和好朋友橘真琴（铃木达央 配音）升上高二，他们与昔日的游泳部成员之一叶月渚（代永翼 配音）重逢。三人回忆起小学时光，约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里，他们居然遇到了归国的松冈凛（宫野真守 配音）。意料之外的是，昔日战友凛性情大变，还对遥发起挑战，结果遥输给了他。
「我」曾一时攀上超热门在线游戏「艾克斯之门ＯＮＬＩＮＥ」的巅峰。在完成某次重大故事后的隔天，想登入游戏时，突然收到「赋予你全新使命」的提示讯息。当我按下「ＹＥＳ」的瞬间，世界被反转了──醒来后，映入「我」眼帘的是──！？
在未来故事中具有重要意义的鱼人岛篇经过重新剪辑，将以比以往更高的画质呈现。讲述了顶上战争2年后的草帽海贼团重新团聚，前往鱼人岛冒险，并挫败了新鱼人海贼团阴谋的故事。
