西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－ PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了
故事发生在信息技术科技已经极为发达的未来，彼时，人类对于电脑和人工智能的依赖已经达到了顶峰，可是这么说，人工智能虽然服务于人类，但同时也掌控着人类生活的方方面面。巨型主机古罗沙是电脑网络的主管，在自我进化之中因为嫉妒的情绪而产生了控制人类的思想，导致整个网络系统都受到了影响。为了限制古罗沙的行动，他的开发者犬养博士制造了八个守护星软件。春日本是一名平凡的女孩，在机缘巧合之下结识了其中一个软件IR，在IR的引导之下，春日进入了虚拟的网络世界，成为了守护星阿结，她的任务是要将散落各处的守护星软件集结在一起。
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老街深处的444号小卖部，是跨越古今的神秘驿站。店主陈默接手这家祖传老店后，发现货架上不仅有寻常商品，更藏着能实现心愿、映照人心的奇幻物件。深夜到访的客人形形色色，有追寻真相的亡魂，有背负执念的生者，每桩交易都牵扯出一段尘封的故事。
