《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
青云宗内卷风气浓烈，吴所谓勤勉修行，还带动师父精进，将驻地练成宗门标杆。奈何选拔遭遇不公算计，她蒙冤被逐出核心阵营。心灰意冷后她归隐后山佛系度日，反倒觉醒逆天机缘，寻常物件皆化珍宝，还解封上古魔尊甘愿追随。无心修炼实力却节节暴涨，最终以淡然姿态逆袭登顶仙门金榜。
两个老朋友竞争对手发现他们在竞争项目中是竞争对手试飞员，而一位共同的旧情人带着她自己的秘密回到他们身边。
