亡国砚国的狐族公主姜瑾,魂穿乱世,险些沦为异族玩物,她奋起反杀逃出囚笼。逃亡路上,姜瑾收拢残将、解救流离百姓,组建瑾阳军。一路剿匪破敌,吸纳匠人、难民,积蓄人力物资。她挥师攻占孤城戈凤,修筑瓮城防御,开荒屯田,把残破小城打造成乱世庇护所。
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价,终于打败了恐龙帝国,但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。