故事发生在从近未来到两百年后的历史跨度上，地球文明被三体用一种叫做智子的超级科技锁死，基础研究因而停滞不前。但人类仍然需要在此基础上不断前进来抵御即将到来的三体人的进攻，守卫自己的家园和人类文明。在更广大的基础上，三体文明和人类文明都是黑暗森林下的猎手，小心翼翼的保护好自己并且清理别人，为文明的存续而挣扎。
少年宁鱼被人毁掉丹田，受尽屈辱，在偶然之下进入了母亲留下的玉佩之中，发现了神魔养殖场，在养殖场内的神魔帮助之下，重塑丹田，走上了一条完全不同的肉身修行之路。
热爱科学的小男孩尼克，在3D打印机上创造了拥有智慧的机器人，并成为了他的小伙伴。机器人小伙伴们个性迥异，都有特别的“功能”，和尼克有着深厚友情。他们会为谁是尼克最好的朋友而争吵，他们经常试图帮助尼克，但常常帮倒忙而让事情更糟糕，但只要他们团结在一起，发挥各自长处，往往就能实现了不起的成就。
