由于漫长的战乱，室町幕府日渐式微世界进入了崇尚血债血偿的战国时代山海秘境，纪之国这片茂密的森林深处，有一个以八咫乌为军旗纹章的枪炮集团。他们以佣兵为业，驰骋沙场，其名为“杂贺众”。继承杂贺众首领名号的人名为孙一，是一名从异国漂流至此的青年。而另一边，最早察觉欧洲列强侵略意图的三郎，则为了守护日本而四处奔走。原本毫无交集的两人随着异国侵略者的袭击而产生了联系。这群身处战国时代的男人会如何贯彻自己的信念与正义。他们的故事正式开幕——！
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主角欧力是一个精力充沛、乐于助人的白色小汽车。欧力和主人斯坦、工程车巴萨、拖拉机加斯罗、消防车罗斯特和汉堡车贝茜一起住在快乐的波波镇。每一天，他们都兴高采烈的穿梭在波波镇的大街小巷，一起愉快的玩耍。
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中
