该剧集延续上一部《金光御九界之墨武侠锋》，讲述了墨乱祸世，九界濒危，墨家九算野心逐一浮现，俏如来等人如何一阻墨乱；另一边，佛门变劫再临，紫金钵之秘将揭开千年圣战，九界之一的佛界天门与地门之间再起冲突！
蛇妖许黑诞生灵智后，因偷食陈家镇的猪闯入猪圈，恰巧遇上被混混扔进来、后被仙人夺舍重生的陈凡。许黑误将陈凡当作可怕的捕蛇人，情急之下吞了他，却没想到陈凡在其腹中不仅没死，还试图夺取他的妖核。一番争斗后，许黑妖核破裂、身受重伤。危急时刻，陈凡的妖族至宝妖神鼎意外吸收了许黑的妖核碎片，反将陈凡吞噬。最终，许黑在光效作用下身体逐渐修复，倒影化作蛟龙。
