圣血天使的攻击巡洋舰“巴尔之剑”号悬挂在尼亚德斯星球的轨道上，被亚空间风暴困住。舰上的星际战士们对他们的无所作为感到恼火。他们的指挥官奥菲欧舰长前往地表调查一个神秘信号，但由于大气信号失真，他和他的仪仗队无法联系到。与此同时，“巴尔之剑”号的舰长，舰长莉维亚·索尔肯，不得不应对尼亚德斯轨道塔的阻挠和干扰。塔上的权威人士究竟在试图向圣血天使们隐瞒什么秘密？
曾折断无数同龄球儿之心的、日本第一的初中生投捕组合·清峰叶流火和要圭，面对来自全国74所名门高校的热情挖角，竟然悉数拒绝、从此销声匿迹……并且出现在一所普通到不能再普通、且没有棒球部的都立高校？背后的原因，竟然是因事故失忆的要圭？
星星球机器人感染木马程序开始伤害人类，由于这种木马程序年代久远，只有过去的时空才能研发出来，于是开心超人回到过去的灵光星，寻找能清除木马程序的和平代码。但没想到的是，开心超人居然回到了和平代码还没有研发成功的时空，此时人类与机器人处于矛盾大爆发的时候……
