乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
这是一个关于你自身的故事。你体内的故事——。
游戏降临，世界规则重构，人类踏入全民转职时代。天才少年叶尘觉醒隐藏职业死灵法师，遭众人嘲笑其消耗寿元。然拥有不死之身的他，召唤黄金亡灵军团、骸骨巨龙，更让魔王撒旦降世，令世界震惊。
新纪元2045年，世界各个区域陆续出现“天罚”，被天罚影响的区域会变成游戏世界，男主李肖所在的地区也受到天罚，区域游戏化，他发现自己成为了玩家，区域结界内的大家纷纷继承了之前游戏中的部分能力，如御兽、RPG游戏、解谜类游戏、修仙游戏、格斗游戏等，各显神通，不做统一详细的等级能力划分。自此开始了一场末日游戏的冒险！
