3022年，蔚蓝星被外星文明入侵，无数的战争机器通过传送站点来到了这里，战争机器疯狂缩小搜索范围，夏执序正在抵抗某种侵蚀......宇宙联邦派遣的队伍——阿尔法-300，同时出现在他的眼前。 “你能想象的魔法或者高等文明科技，其实是存在的。” 陈星瑶说出了这句话，她自称来自宇宙联邦纠察队——用可视化科技面板进行任务沟通，物品收纳，技能使用。 在接二连三的险情中，夏执序发现很多疑点，决定加入阿尔法-300，去变的更强，去探查那个真相。
文化枢纽守护者玉龙化身凌小玉，与伙伴羊光光、菲袅遭遇魔盗联邦入侵。反派为从根源摧毁龙文化，穿越至五千年前的凌家滩，主角团紧随其后却失去所有超能力。他们被先民误认邪灵，结识质疑祭司谎言的少年阿福。反派破坏龙脉引发天灾，蛊惑先民砸碎玉器、颠覆信仰。凌小玉的“维持秩序”与阿福的“揭穿谎言”双双失败，最终阿福牺牲自我唤醒龙脉，凌小玉放下执念与之共振击退反派。先民将二人形象雕成玉龙与玉人，成为后世凌家滩文物的由来。
因过去的心理阴影而以独自的别扭思考回路讴歌着“独自生活”的比企谷八幡，由于意外的事件而被生活指导担当教师平冢静带去“侍奉部”并加入其中。他和同社团所属的令人窒息的完美美少女·雪之下雪乃，以及班级上位阶级所属的时髦女子·由比滨结衣一同，从解决班上的人际关系问题到文化祭实行委员的运营，度过着解决各种案件的每一天。时至秋日，八幡等二年级学生前去修学旅行。此时，侍奉部接收到的委托究竟是！？随着新登场的一色彩羽的加入，他们的关系更加错综复杂。——八幡空虚的价值观也有了少许变化，在这些经验过后，他的高中生活又将迎来怎样的展开！？
历经层层艰险与重重考验，索菲亚与伙伴们在一次次并肩作战中，与各自相伴的独角兽结下了无比深厚的羁绊。他们彼此信任、心意相通，成功解锁了独角兽潜藏的强大魔法力量，凭借着勇气与默契携手守护着独角兽岛的和平与安宁，让这片神奇的土地始终充满光明与生机。当象征着祥瑞与魔力的精灵之月缓缓降临，命运精灵的力量也随之达到巅峰，整个独角兽岛都被温柔而神圣的光晕笼罩。此时，独角兽骑士们接到了全新的使命：他们需要与各自的独角兽伙伴一同出发，前往秘境深处，采集只在精灵之月期间悄然绽放的星耀之花，用以装点即将到来的盛大舞会，为庆典增添梦幻光彩。就在众人满怀期待、紧锣密鼓地为任务做准备时，伊莎贝尔却心事重重。她敏锐地察觉到，自己与独角兽蓝河之间的联结似乎悄然出现了隔阂，往日的默契与亲近仿佛蒙上了一层薄纱，这让她既困惑又不安。
