《灵剑尊》是由索以文化制作的3D动画。根据同名小说《灵剑尊》和漫画《灵剑尊》改编。该动画讲述了落魄少年楚行云立志要改变现状奋发图强创造一片新天地的故事大梦一场，落魄少年立志要改变现状奋发图强创造一片新天地。珍奇异宝，功法武决，遗失的强者洞府，在这个天才辈出，充满挑战和机缘的时代，且看落魄少主如何闯荡大陆、遭奇遇，成为叱咤风云的至尊天帝。以前的仇人，现在，绝不会放过！梦中的遗憾，现在，一定要弥补！待到灵剑长啸之时，天地三界，我为至尊！
架空战国时代的日本被未知生命体“鬼神”统治已有150年，唯有“武士团”反抗其统治，一直不懈抗争。武藏和小次郎也曾向往着武士，发誓有朝一日结成最强的武士团。可是，他们所生活的城镇却将鬼神奉为神明，将武士视为异端。武藏只能将梦想藏在心中，直到有一天，他遭遇了人类被鬼残忍杀害的一幕。为了重拾与小次郎的誓言，武藏向强大的鬼发起了挑战…！
阳城大学一夜之间被黑雾笼罩，校园变成充满考验的生存之地。顾清寒意外觉醒特殊天赋，成为隐藏在暗处的班长。面对失控的规则、恐惧的人群和接连不断的危机，她没有选择逃避，而是用智慧守护同伴、重建秩序。青梅竹马陆清宴始终陪在她身边，用勇气和信任为她挡下危险。两人带领同学团结协作，在一次次考验中学会责任、牺牲与坚持，也让冷漠的校园重新找回温度。当黑暗试图吞噬所有希望时，他们选择并肩向前，用善意凝聚力量，用行动证明：只要彼此守望，就没有无法战胜的困境。
被撤职的锦衣卫袁小棠与青梅竹马的方雨亭为寻找父亲失踪的线索潜入鬼街、在朋友石尧山等人的帮助下，一路逛鬼街、破机关、遇各路神秘人物……乱斗与阴谋轮番上演，随着旧事的重提，一切谜团都渐渐有了答案。
