在某个平凡的夏日，东京遭到了炸弹恐怖袭击。导致日本从平稳的睡梦中惊醒的犯人，仅仅是两个少年。自称为“斯芬克斯”的犯人们，将把全日本卷入一场壮大的游戏。
性格呆呆的孙燃同学最近认识了酷酷神秘的小太同学，在小太同学的影响下，孙燃变得开朗大方，并且拥有了自信的力量。与此同时学院又来了一个叫悟小球的调皮孩子和一个直来直往的焦二郎。四个少年组队冒险闹出不少爆笑滑稽的故事！童趣开心，见证友情与自信的力量！小小神将少年班出发！
为了迎接未知的挑战，闪电机甲全新升级加入作战，他们的机车可以变形为机甲状态，动物们可以通过跟小雨点结合进而召唤出带有动物特点的武器，对抗以霹雳为首的恐龙队。护卫队成员们在任务中相互协作，发挥各自特长，不仅帮动物们解决问题，还向动物们学习本领，一起成长！
