《海底小纵队 第十一季》继续带领小朋友开启冒险。队员们深入海底、穿越丛林、探索极地，救助各类动物。在北极应对雷暴，助丽色凤头燕鸥回归；护草原犬鼠、熊猫等动物，处理海鼻涕、森林大火等问题；还探索洞穴、见证物种迁徙，传递环保、合作与勇气的理念，强化生态保护意识。
三百年后的奇轮星，地球和奇轮星可以通过奇轮火车来往，奇轮射手和奇轮人自由组成搭档进行奇轮对战比赛！但以罗伦为首的黑暗兵团正策划着一个以毁灭奇轮星为目的的阴谋。在《激战奇轮》中第一代的奇轮王烈焰，收到现任奇轮女王凤凰的召唤来到了这里，与李小萨成为搭档参加奇轮大赛。在比赛的过程中，结识了吴官月、陈石武等怀着共同梦想的小朋友。大家从相识、互相了解，到最后共同领悟奇轮魂的真谛，击败毁灭战神，化解奇轮星的危机。在一次次的战斗过程中，小朋友们学会了相互理解、团结友爱、永不言败的精神，明白到只要付出努力，就能得到成功的真正意义。
