灭世洪水降临，90%的陆地被淹没在波涛之下，幸存者在孤岛上苟延残喘，浪潮汹涌，海兽肆虐。林歌在一块漂浮于茫茫海面的破木板上醒来，依靠大航海旅游系统将破木板一步步扩建，打造成移动的海上之城，并收服一众追随者，向着传说中的极北冰原进发，寻找灭世洪水的真相。
哈洛克 (S-00999)、大山藤一郎 (S-00998) 和艾梅拉达斯 (X-00001) 乘坐阿卡迪亚号逃离被侵略者伊鲁米达斯占领的地球。随后，他们被列入全宇宙通缉名单，通缉代号为 SSX，尽管遭到了 Illumidas 军队的攻击，他们仍然与包括外星人 La Mime 在内的同伴一起继续旅程，寻找他们认为存在于宇宙某处的乌托邦“阿卡迪亚”。战斗中，地球男孩物野忠、女孩利威尔和雪萤加入了队伍，班博士则担任船医。另一方面，伊路米达斯地球占领军命令年轻的天才科学家佐恩先生对阿卡迪亚号进行分析和调查，以建造一艘超越阿卡迪亚号的飞船。佐恩先生也踏上了前往阿卡迪亚的太空之旅。
史酷比和其他著名超级英雄联动推出的动画剧集
