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美术大学学生竹本和学长真山以及多次留级的森田一起生活在单身公寓里，大家的生活风清云淡却也乐趣无穷。
与地球不同次元，名为“疫苗界”的地方是个和平稳定、四季如春的世界。某天，封印在那里的病毒大王“暗魔”逃了出来，往地球的方向逃亡。正为此事烦恼的疫苗界女神“玛雅”命令见习守护兽“麦丸”去追捕暗魔及暗魔所生出来的病毒。对于其他次元的事一无所知的地球中，有一位不怎么出名的新人偶像——中原小麦。她在池袋的一个会场工作时，奉命追逐病毒却反而被攻击受伤的麦丸从空中掉了下来。被小麦抱住的麦丸感受到了她爱的力量，于是将魔法手杖交给小麦，说明了事情原委。虽然小麦对这件突如其来的事情感到困惑，但是由于她单纯且对有困难的人无法见死不救的个性，便一口气答应下来…。于是，小麦除了担任魔法少女之外，还要从事偶像的工作，而学校也不能不去，小麦变成了一个大忙人。话说回来，她能够用爱的魔法拯救地球吗？收起
在游戏中心打工的青年草壁莲司，偶然目睹了一幕：情人节当天，一位英国少女莉莉独自一人沉迷于抓娃娃机。无论尝试多少次，她始终无法抓到奖品，眼看着要落泪的她，让莲司忍不住伸出援手。在成功抓到娃娃后，莉莉几天后送给莲司一张意想不到的信息卡——“Be My Valentine!”（请做我的恋人！）这是与一位可爱而天真烂漫的英国少女的邂逅，一个因误会而起的异文化交流故事，就此在游戏中心展开！
