住在安第斯山脉的印第安男孩佩佩罗在十岁生日的第二天目睹了传说中的“黄金秃鹰”，并踏上了前往黄金城埃尔多拉多的旅程，据说那里有可以拯救穷人的宝藏。这次旅程也是为了寻找七年前前往黄金国后失踪的父亲卡洛斯的下落，以及在看到“黄金秃鹰”那天遇到的女孩奎娜失去的记忆。
该系列动画以马里奥、路易吉和碧琪公主为主角，他们现在和耀西一起生活在恐龙大陆（有时也叫恐龙世界）。耀西在剧中被描绘成一只好奇心强、像孩子一样的恐龙，它食量惊人，而且有很多恐惧症。库巴大王（又名鲍泽）和他的库巴七子也来到了这里，他们一路跟随超级马里奥兄弟和公主来到了恐龙大陆。
