该剧主要讲述了以卡丁为主的魔法少年与邪恶势力较量的故事，通过寓教于乐的方式形象的阐述了“勇气、勤劳、智慧、善良、正义”的力量与意义，展示了卡丁等人团结、坚韧、勇于担当的精神。
这是一场在瑰丽奇幻的思量岛上发生的关于阴谋与救赎的故事。从主角镜玄探寻父母逝世真相的事件切入，一步步揭开思量岛上的秘密往事，同时展现了一群年轻人为了各自的人生目标努力蜕变成长、挣脱枷锁的故事。
宁静的小镇村住着一位神秘的尤教授，他通过科学实验创造出了三个拥有超级力量的完美女孩，她们的名字分别是：泡泡、毛毛和花花。泡泡的性格在三人之中最为天真开朗，毛毛的性格在三人之中较为暴躁易怒，花花则是天生的领袖和代言人，她们三个人互相帮助，补足对方的不足，组成了以惩奸除恶为终极使命的“飞天小女警”组合。在小镇村内设有专线供村民们呼叫飞天小女警前往帮助他们，小女警们的首要任务就是与各方反派势力斗智斗勇。三位超能小女警需要在小镇需要她们的时候出动，打击罪犯，用自己无与伦比的“女孩力量”守护家园和身边的小镇居民们。在本季中，小女警们将花费一整天的时间探索尤教授的实验室，并发现里面其实有令她们意想不到的秘密。
随处可见的普通高中生——柏树朝。有一天5个来自世界各地的女生转来了他的班级：爱生、阿米莉亚、卡琳、伊莉雅、梦华。尽管跟她们的初次相遇可是说是非常糟糕，但放学后不知为何她们全员向朝表白了。虽然一开始拒绝了她们的表白，但是听到少女们「没有其他地方可以去了」的心声，朝心一软开始了同居。然而从那以后朝的非日常生活开始了。朝每天被采取离奇举动的少女所折腾。以及发生在身边的、难以想象的、不可思议的事情。然而，在这种可以说是异常的日子里朝与这些少女打成一片，心灵相通。在忙并快乐着的日子开始不久的某一个夏日。朝与阿米莉亚、卡琳、伊莉雅、梦华4人来到海边度假。然而阿米莉亚等人在朝的面前突然消失，留下的只有沙滩上的脚印。朝也因此感到十分混乱。此时在朝面前出现的是并没有参加度假的爱生。记忆混乱之时，朝忘记了阿米莉亚等人的存在，在海边的别墅内与爱生过着二人世界。然而朝对这一切逐渐产生了违和感。爱生察觉到了朝的困惑，为了阻止他胡思乱想，爱生将朝带到了某个地方。在盛开的樱花树下，爱生向朝表达了自己的爱慕之情。然而完全想起阿米莉亚等人的存在的朝，向爱生询问了大家的去向。下一个瞬间，一阵强风吹过，回过神来，爱生的身影已经不见了。取而代之的是一名少女。5名少女就这样消失了吗？出现在朝面前的名叫「爱」的少女到底是谁？她们与朝复杂的过去即将揭晓。
在小镇的阳光森林幼儿园里，小朋友们每当遇到困难，他们心中的大英雄——百变校巴，就会变身成为警车、消防车、救护车、救援艇、潜水艇和飞机立刻赶到，利用渊博的知识和各种有趣的道具化解危机，守护小朋友的安全，解答小朋友的疑问，并且他和蔼可亲，是小朋友们的良师益友，平常帮助小朋友了解自己的情绪，学会处理社交问题。全新的《百变校巴》第六季，校巴歌德将继续陪伴小朋友，与大家一起进行各种体育运动。让小朋友认识自己的情绪，学会与人沟通，同时深入探索团队精神。并且通过介绍不同的运动规则，让小朋友学习更多运动科学知识，帮助他们安全锻炼身体，提高身体素质，在运动中收获乐趣。
