妖界覆灭后，妖族在人界流离失所。九宫家将长女九宫良子派往华修国“六十门”留学，暗中收集妖怪并送回太阳岛。王令等人在与九宫良子的相处中，渐渐发现了她和整个九宫家族的真实目的……逆天的仙王大人，这次又要偷偷地为何而战呢？
和风吹拂的美丽大地·阿斯特雷亚大陆。在大陆的一角，失去记忆的少年·佑树醒了过来。照顾他的小小向导·可可萝。总是肚子空空的美少女剑士·佩可莉露。略显高冷的猫耳魔法少女·凯露。他们就这么在命运引导下，建立起名为「美食殿」的公会。现在，佑树与她们的冒险即将开幕——
夜晚，洛洛在家里玩电脑游戏，突然落雷击中大厦，洛洛被传送到一个陌生的世界里。醒来之后，洛洛发现自己竟呆在一个以他最喜欢的机战游戏作为背景的虚拟世界。过不多久，茫然的洛洛就遭到猛兽族黑铁兽的袭击，差点小命不保，幸好时光之城的大将霹雳火及时出现将他救下，才避过猛兽族的追杀。洛洛与霹雳火结识成为朋友了，命运滚轮的转动无法避免，机战世界开始书写新的章程。
西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－ PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了
