在进行机甲武斗大会的冠军战时，布莱札德突然来袭，十年前他们也曾侵袭而来，但不知为何他们这次就很干脆地撤退了。然后这样过了好几个月的某日，在创世纪特区的里昂一行人正要接受训练时，天空突然出现异常现象，竟然出现了镜像世界的里昂他们，这到底是怎么一回事呢？
喜羊羊及灰太狼等一众守护者们为了提升能力，进入深山密林进行特训，他们分别找到了传说中的两所训练营，羊狼们分别进入不同的训练营，开始了各自神奇奇术和炫酷发明的训练生涯。训练过程中笑料频出，大家克服重重困难学到了本领，也建立起深厚的友谊，两大阵营联手迎击来自未知世界的反派，开启羊村守护者全新的篇章。
以拯救蓝星为目的被制造出来“最强胚胎”品翔，被寄以厚望，将在被设定好的时间设定好的地点设定好的足球比赛中，一脚拯救世界！可他点错天赋，熟练的掌握了各种无关紧要的技能，除了足球......
以水乡绍兴为背景，主人公机智可爱，剧情精彩纷呈，动画制作精良，歌曲清新婉丽，似缓缓展开的一轴绍兴特色江南画卷，吞吐千年文化之神韵。
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
