修真界因天机碎片纷争四起，经脉残缺的叶辰虽无法修炼灵力，却拥有顶尖推演天赋。宗门覆灭后，他携同伴与至宝逃亡，借至宝觉醒能力，闯荡各方势力、收集碎片。临近终点才发现自己沦为敌人棋子，绝境中逆转因果，挣脱算计，以本心打破宿命，终结天机棋局。
卡特公司利用人工降雨散播致命病毒，世界沦为末日废墟。少数拥有病毒抗体的人类，成为卡特武装部队的猎杀对象。失忆少年林野在废墟中醒来，意外免疫病毒，踏上逃亡与觉醒之路。他结识同伴、组建抗体者联盟，从逃亡者蜕变为人类希望，最终摧毁卡特阴谋，终结灾难，拯救世界。
《灼眼的夏娜》TV第二季的故事将从小说第八卷开始讲起，以NDS游戏《灼眼的夏娜DS》中的登场人物，红世之徒，戏睡乡“メア”入侵御崎市开始开篇。据监督渡部高志所说，故事会对第一季的一些伏笔作出解释，并加入不少这个时代的小故事。第二季STAFF和声优会由原班人马担任，“钉宫之誓”依旧强势走高。夏天结束后，新学期开始了许多事物没有任何变化，但是同时也有不少事情逐渐发展着…池和吉田，绪方和田中之间产生了些许微妙的关系还有在我身旁，飘逸着长发的夏娜…但是，这一切似乎有着一丝奇怪的违何感在我们所不知道的地方，红世之徒再次展开了行动…
整个世界都灭绝了，人类也消失的无影无踪.没有动物，没有桥梁，没有青山， 也没有绿树。只有蓝蓝的天空，和流动的空气。你只能远远看见一家破旧但是完好的房子，标示上面写着“糖果铺 “。在屋子里面有一个巨大的糖果机器， 里面盛满了上百颗糖果。对于Zelly 杰力们来说，追寻糖果是它们一生的命运。喜欢吃糖果是它们的本能驱使。裁制银币，制作炸药，但是糖果机器就是无坚不摧， 从来就不能被打开或者被破坏。也许，糖果就默默得躲在背后，它们最后能吃到糖果吗?
高中三年级的冬天。高中生活剩下的时间已经不多。这样下去总有一天会迎来毕业，任谁都是这么想的。
