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一对一起做实验的高中校友守着一个秘密：其中之一的Marshall发现了全世界最厉害的药物，是一种可以治愈几乎一切病痛的蘑菇。但是，要将它介绍给全世界是非常艰难的：美国缉毒局、大型制药公司和国际上的商人们都想阻止其面市。
"名字被写在这个笔记本上的人会死"死神琉可拥有这样的死神笔记本，却将它遗失在人间。天才高中生夜神月捡到这本笔记本，本以为是恶作剧的他，在笔记本上写下了电视中播放的罪犯的名字，确认了笔记本能力的真实性。厌倦腐朽世界的夜神月使用笔记本的力量，开始杀死犯罪者，以此希望建立一个没有犯罪的美好理想世界，而自己成为“新世界的神”。连续罪犯死亡事件，吸引了全世界警察的目光，更吸引了世界第一名侦探L的注意，L能否将被崇拜者称为“基拉”的夜神月逮捕？一本死神的笔记本，拉开了天才与天才之间卓越巅峰的头脑战争的序幕。本已对人间失去兴趣的琉可，在旁观惊心动魄的斗智过程中感叹“人类，真有趣。
