文化枢纽守护者玉龙化身凌小玉，与伙伴羊光光、菲袅遭遇魔盗联邦入侵。反派为从根源摧毁龙文化，穿越至五千年前的凌家滩，主角团紧随其后却失去所有超能力。他们被先民误认邪灵，结识质疑祭司谎言的少年阿福。反派破坏龙脉引发天灾，蛊惑先民砸碎玉器、颠覆信仰。凌小玉的“维持秩序”与阿福的“揭穿谎言”双双失败，最终阿福牺牲自我唤醒龙脉，凌小玉放下执念与之共振击退反派。先民将二人形象雕成玉龙与玉人，成为后世凌家滩文物的由来。
万年前，魔君为护所爱，孤身持上古四剑踏上天路，硬撼天道，崩碎本源，留下万古裂痕，自身陨落轮回。万年后，江辞携魔君转世之身重临世间，与月神洛清河再续宿命前缘，尘封万年的上古四剑相继破封出世。天道秩序欲抹除一切变数，傀儡分身布下天罗地网。他以弑神戟为锋，以四剑为阵，以一身傲骨逆天而行。何为天命？何为定数？若九天皆为牢笼，我便一剑破之！若天道执掌宿命，我便亲手逆之！
实验室爆炸，现代灵魂意外坠入大秦，附身身陷天牢的长公子扶苏。朝堂之上，始皇震怒，因扶苏力护文脉、顶撞君威，将其囚禁。帝王要肃清六国邪书、稳固新政，并非毁典籍，却遭扶苏误解。嬴政下最后通牒：令扶苏亲督整肃，事成则赦，不从则严惩。
太阳岛事件后，王令和伙伴们重新回归了自己向往的和平日常。华修国的传奇剑圣为寻找衣钵继承人，隐姓埋名进入六十门担任体术指导。然而，他的师弟，人送外号邪剑神的天字号恶人陈南玄却对师兄积怨已久，邪剑神的一众徒弟也因各种原因与王令、孙蓉结下梁子，面对他们的挑衅，王令又会如何应对呢？
