《男子高中生的日常》以真田北男校为舞台，围绕着主角忠邦（入野自由 配音），以及他的死党秀则（杉田智和 配音）和吉竹（铃村健一 配音）的日常高中生活而展开。忠邦主要担任吐槽的角色，长相中性的他常常被秀则和吉竹联合欺负。登场人物还有同校学生会的元治、唐泽、副会长和会长等人，这是一群基本上没有女朋友的男校学生，在鲜有女生参与的情况下，展开了插科打诨的日常高中生活。
凡人少年陆长庚，为救病重母亲，以凡人之躯苦役三年，只求一颗救命仙丹。机缘巧合下，他因诚实通过河神考验，获得一把能劈开空间、连通仙府的上古仙斧。凭借仙斧与五行杂灵根的废物资质，他在绝境中逆天改命，踏上修仙路。为求得母亲解药，他被迫卷入太微门四大长老与前代掌门遗留的血仇漩涡，成为所有人博弈的棋子。身处死局，他一边藏拙周旋于各方势力之间，一边与同样心怀死志的疯癫护法莫老结下亦师亦友的羁绊。最终，他在死局中破局，拿到解药全身而退，带着故人的嘱托与信念，真正踏上了那条属于自己的仙途。
