本片描述了香港反黑组的组员惩治罪恶的英勇事迹以及他们个人感情经历的点点滴滴。人称“筋肉人”的反黑组探员阿喜（吴毅将 饰）立功无数、屡破奇案，但却因脾气倔犟，向来专横而和同事们诸多不顺。刚刚加入的康仔（陈浩民 饰）更是对阿喜诸多怨言，甚至想申请调组。后来一起办案多了，反黑组内部终于彼此了解，一团和气。反黑组内也有不少情事，一次上司阿凡（黎耀祥 饰）结识了卖鱼女阿娇，两人成了欢喜冤家；而阿弟（邵美琪 饰）更是一直暗恋阿喜，他们在工作上、感情上正经历着一次又一次的考验。
雷厉风行的大家长乔海云曾定下规矩，每逢过年所有人必须回家过，一直以来从未有人坏过规矩，直到最老实的第三代李衣锦突然打破传统去了男友家过年，引发家族矛盾。乔海云育有三女，老大孟明玮非亲生，因跛脚自卑所以望女成凤，和女儿李衣锦关系十分紧张，但最终她们体谅了对方的苦衷，终于明白保持适当的距离才是维系母女关系的良方；老二孟菀青与学霸女儿陶姝娜堪称完美母女，但无话不说的二人却无意中发现了彼此的秘密，重新认识彼此的过程也是重新认识自己，二人最终明白完美的母女关系不是遮掩缺点而是彼此支撑；老三孟以安最像乔海云，强势又独立，不想变成母亲那样的女强人，却机缘巧合与母亲走上同一条路，事业家庭平衡之艰难让她渐渐理解了当年的母亲。孟家祖孙三代女性犹如群岛一般，虽遥遥相望，却相扶、共生。
一位最近丧偶的儿童心理学家会见了他的下一位客户，这位客户似乎以某种方式与他的过去有关。
在调查一起重大抢劫案时，联邦探员需要打开思路，才能破解迷题。
故事开始于山东藩台，杨康源因挪用军饷而被定罪，临刑前将妻女托付给山东巡抚高敬堂。高敬堂为了赎回被卖进妓院的杨妻和两个女儿杨二娥和杨三娥（杨若兮 饰），让次子高成栋娶了二娥为妻。然而，高敬堂的填房夫人林媚春与高成栋私通，引发了一系列不可预测的后果。林媚春妒火中烧，安排吴献铭使计让二娥误解高成栋与她的关系。当三娥发现真相时，二娥却选择保守秘密，使得局势更加错综复杂。为了阻止二娥揭露真相，高成栋不惜使用砒霜毒死了她。林媚春酒醉后发现了二娥的尸体，但被买通的阴阳先生声称二娥死于血崩。杨母和三娥赶到高家时，二娥已经入殓，而三娥却对姐姐突然死去感到疑惑，要求开棺验尸却被拒绝。在这一过程中，杨康源的文书黄全为了照顾杨家母女，辞职回乡。他帮助三娥起草状纸，告发高家。知县陶钰接受了这个案子，而药铺掌柜的供词揭露了吴献铭购买砒霜的事实，导致吴被押入死牢。然而，高成栋送来银票后，陶钰以砒霜中毒证据不足为由，草草结案，使得三娥的第一次告状以失败告终。
一起下水道的凶案，让刑警队长徐骁和老刑警林国强碰到一起，两人探案手法风格迥异，但因为对真相和正义的共同追求，逐渐弥合了观点上的分歧，结成亦师亦友的老少搭档。在破案的过程中并不顺利，在考古学者陈楠的帮助下，他们发现作案的凶手有着某种邪恶的思想，凶手难觅、迷雾难驱，他们虽分歧不断，但仍朝着一致的目标倾力探寻。最终使凶手伏法。
凤来高中3年D班的班主任九条里奈，是放弃贴近时代、贴近学生的化学教师。毕业典礼那天被“班里的某个学生”推下去，然后时光倒流，站在讲台上，眼前看到的是一年后杀害自己的“30名嫌疑人”。她下定“决心”，颠覆教室、人生，冒着生命危险挑战面对学生。
