故事发生在以音乐为中心、次文化兴盛的涩谷，与能映射出人们内心“真正的心愿”的「世界」中。某天，一直用音乐给人们带去力量的虚拟歌手初音未来，发现自己的歌声无论怎样都无法传达出去……而一群在「世界」中追寻音乐梦想的少年少女们与初音未来相遇，共同寻找着可以让初音未来“将歌声传达出去”的方法。
这是一个魔女与人类共存的世界，为了保证魔女的身份不被揭穿，被人类发现了真实身份的魔女都会变成魔女青蛙，唯有另一个拥有正式身份的魔女才能够解开魔法。一次偶然中，一直梦想者能够成为魔女的少女春风Doremi（千叶千惠巳 配音）撞破了魔女莉卡的身份，无奈之下，莉卡只得将春风收为见习魔女。春风必须经历漫长而艰苦的修炼，通过魔女的考试才能够正式获得魔女资格在此之后，成熟稳重，性格文静的藤原羽月（秋谷智子 配音），精明强干活泼好动的妹尾爱子（松冈由贵 配音），傲娇跋扈但内心善良的濑川音符（宍戸留美 配音）春风的妹妹春风泡泡（大谷育江 配音）等人都因发现了春风的身份而接连成为了见习魔女。随着时间的流逝，对于女孩们来说，通过魔女考试反而成为了次要目的，最重要的是，一定要利用各自的魔法能力让人们获得幸福。
水族箱里诞生了4条小鱼，其中包括哈罗德的女儿伊莎贝尔。伊莎贝尔的身上长着不好看的斑点还缺失了一些鳞片，她的长相遭到鱼群的其他成员嘲笑。鱼群首领瑟斯顿要求哈罗德必须把伊莎贝尔藏起来否则被人来发现将会把他们丢进大海里。贪玩的伊莎贝尔还是被人类发现了，她和哈罗德一起被丢进浩瀚无边的大海里。海上突如其来的巨大风浪使得水族箱里的鱼都掉进大海,一时之间，伊莎贝尔和哈罗德失散了。伊莎贝尔偶遇了艾普尔并结识了一群长相奇特的鱼，它们皆因外在缺陷被同族排挤。在艾普尔的带领下，伊莎贝尔和其它鱼准备穿越火山抵达珊瑚礁寻找哈罗德。另一边，哈罗德在海黄瓜卡尔的陪同下找寻女儿未果，伤心欲绝，随鱼群离去。成功穿越火山的伊莎贝尔在珊瑚礁与哈罗德相遇，而珊瑚礁女王的出现更令父女惊喜，原来女王竟是伊莎贝尔的妈妈。一家人欢聚在一起。
世界的崩溃开始了。 暴走的大缅因猫兽吸收了黑暗进化的迪路兽、 用强大的力量进化成了秩序兽。 根据世界树的想法，现实世界将被数码世界所吞噬。 在绝望迫近的时候，被选中的孩子们拼命地向前。 现在太一不在了，能代替他带队的只有大 和。 「为了拯救世界，我们还有必须要做的事情！」 加布兽的话给大和带来了活力，而亚古兽则坚信太一定会回来。 另一方面，恒常性要处置失去控制的秩序兽、 并尝试施行干涉现实世界的最终计划。 为了阻止毁灭的到来，被选召的孩子们和他们的搭档拼命地战斗。 「所有的光芒，都汇聚在了缅因猫兽…」 绝望的迪路兽向大家说到。 孩子们做出最后决定的时候到了。 被选中的孩子们，自己将选择怎样的未来？ 现在，冒险将再一次进化。
清晨的公园里，老人格里慢慢的铺开棋盘，把棋子一个一个的放上去，“对弈”就这样开始了。
如果，樱花掉落的速度是每秒5厘米，那么两颗心需要多久才能靠近？
安德鲁蒙神拣选，脱离顽皮的童年，进入神的国度，安德鲁必须经历试炼、考验和属灵争战，才能最终领悟神国的奥秘。
小狗阿憨来到陌生的猫之国度，寻找对他有救命之恩的剑客高手，想要拜他为师。不想在这猫领地，狗是最不受欢迎的，就在阿憨要被无辜处决时，猫领主伊卡丘却选他做新一任小镇治安官。不知情的阿憨满怀希望前去就任，却被痛恨狗的猫居民们群起而攻之。机缘巧合下，阿憨遇到了曾经叱咤一时的剑客高手金宝，发现金宝正是曾经救他的侠士。意识到自己能力不济的阿憨恳求身怀绝技的金宝训练他，而金宝也勉强同意收阿憨为弟子。金宝教会了阿憨什么是剑客之道，而阿憨也让金宝重新找回对生活的热情。一猫一狗联手保护小镇，挫败了伊卡丘的阴谋。
菲利普与佐伊是一对星际宇航企鹅，以航向无雀能至的外太空为志。他们乘着那艘平易近人、会说话的太空船“雪泥号”，在敬爱的斯黛拉船长带领下，身怀实地考察大本营的任务，向着星辰踏上了一番和平的探险。
1910年，法国巴黎。电影院放映员埃米尔（Sébastien Desjours 配音）和他的朋友罗尔（Gad Elmaleh 配音）来到某科学家的实验室送货，科学家恰好不在，两个人胡乱动实验室的药品，...
当新的和平时代受到强大的魔法联盟的威胁，并可能给一切带来终结时，梅利奥达斯和他的朋友们重新开始行动。
